Les missions du poste
Mission :
Au sein du pôle Biométrie de la plateforme RaDico, vous effectuerez les tâches de Data Management pour des études de cohorte de patients, en lien étroit avec vos collègues de la Recherche Clinique et du Système d’Information de RaDiCo.
Vous assurerez la conception, la mise en production et la mise à jour des formulaires électroniques de l’e-CRF servant à la collecte de données pour chaque étude de cohorte de RaDiCo. Vous utiliserez l’application REDCap pour la création et le paramétrage des eCRF sur la base des CRF annotés fournis par vos collaborateurs de la Recherche Clinique.
Vous préparerez le Plan de Management des Données et le Plan de Validation des Données pour les études de cohortes que vous suivrez.
Vous participerez à la réflexion relative à la méthodologie statistique de la recherche, aux questions méthodologiques qui surviendraient au cours de la recherche et à l’analyse statistique des données des cohortes.
Activités principales :
- Rédiger et/ou mettre à jour la documentation spécifique déjà créée relative à l’activité de data management (Cahier des charges, Plan de Data Management, Plan de Validation des Données, …),
- Proposer et valider le circuit patient,
- Paramétrer sous REDCap des e-CRF à partir des spécifications (CRF annotés) préparés par les collaborateurs de la recherche clinique Développer les mécanismes de synchronisation des dictionnaires de métadonnées et ontologies de référence (ex : Human Phenome Ontology) Participer à la validation du cahier des charges de data monitoring Participer aux réunions de pré-mise en place et de suivi des études Former les utilisateurs de REDCap (TEC, ARC, cliniciens, etc.) Paramétrer et émettre les requêtes, contrôler et valider les réponses aux requêtes
- Réaliser le processus de gel de base et préparer les fichiers de données pour les biostatisticiens
- Archiver la base de données gelée
- Piloter et améliorer en continu les procédures internes relatives à ces activités et leur industrialisation, pour en garantir la qualité et adhérer aux standards internationaux recommandés
Activités associées :
- Participer à la rédaction de la section statistique des protocoles de recherche
- Réaliser les analyses exploratoires multivariées, incluant les modèles de survie
- Programmer sous R ou SAS
- Participer à la rédaction des rapports statistiques d’analyse des données des cohortes
- Contribuer à la rédaction des publications et des abstracts
Connaissances :
- Procédures de data management : Connaissances approfondies
- Gestion de données cliniques : Connaissances approfondies
- Réglementation et législation relative à la recherche médicale (Code de la santé publique, Bonnes pratiques Cliniques) : Connaissances générales
- Protection des données nominatives : Connaissances générales
- Éthique et déontologie médicales : Connaissances générales
- Culture et vocabulaire médicaux : Connaissances générales
- Milieu hospitalier : Connaissances générales
- Méthodes en épidémiologie quantitative Modélisation biostatistique
- Sécurité informatique-sécurité des systèmes d’information : Connaissances générales
Savoir-Faire :
- Concevoir et exécuter un plan de test et de validation pour un e-CRF
- Programmer et valider des requêtes en data management
- Programmer dans différents environnements informatiques (ex : programmation du logiciel de traitement de données et SAS et/ou R)
- Concevoir et réaliser les plans d’analyses statistiques
- Interpréter les résultats des analyses statistiques
- Programmer dans différents environnements informatiques R et / ou SAS
- Rédiger et mettre en forme des notes, documents et/ou rapports, relatifs à son domaine de compétence dans un français de qualité
- Utiliser les logiciels bureautiques
- Pratiquer couramment l'anglais scientifique
Aptitudes :
- Etre force de proposition
- Avoir l’esprit d’équipe, un bon relationnel
- Faire preuve d’autonomie
- Etre organisé et rigoureux
- Avoir une bonne capacité d’adaptation
- Présenter un intérêt pour les maladies rares
- Avoir une communication aisée
- Avoir l’esprit d’analyse et de synthèse
Niveau de diplôme :
- Master en informatique appliquée à la gestion des données biomédicales ou équivalent ou Master en statistiques ou équivalent
RaDiCo un programme coordonné par l'INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médical). La plateforme regroupe dix cohortes maladies rares (MR) sélectionnées par un jury international.
Ces cohortes couvrent 67 maladies et ont pour objectifs de :
- décrire l’histoire naturelle de la MR ,
- identifier les gènes en cause,
- établir des corrélations phénotype-génotype,
- élucider leur physiopathologie, v) identifier de nouvelles pistes thérapeutiques, vi) évaluer leur impact sociétal et médico-économique,
- identifier les patients éligibles pour de nouvelles approches thérapeutiques.
Radico propose une plate-forme opérationnelle nationale.
Assimilable à une infrastructure, elle permet de développer des e-cohortes maladies rares (MR) répondant à de stricts critères d’excellence. Les processus sont industrialisés et suivis par des indicateurs qualité.
Radico permet une mutualisation des savoir faire et des outils nécessaires à la création d'une base de données partagée.
Cette base de données est interopérable, fondée sur le « cloud computing », sécurisée, conforme au RGPD, avec un suivi continu de la qualité des données et de leur cohérence, et adaptée aux échanges avec le système nationale des données de santé (SNDS) et le Health Data Hub (HDH).
https://francecohortes.org/cohortes/annuaire-des-cohortes/RaDiCo