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MEDITWIN est un projet qui associe partenaires académiques et industriels. Il vise à proposer des jumeaux virtuels personnalisés des organes, du métabolisme, des tumeurs cancéreuses, pour mieux diagnostiquer et mieux soigner. Avec MEDITWIN les médecins pourront en particulier simuler les scénarios thérapeutiques pour chaque patient.
En tant que Data Scientist, vous travaillerez au sein de l'équipe Oncology Twin, faisant parti du département de Dassault Systèmes Corporate Research. L'équipe est géographiquement divisée entre la Bretagne et l'Ile de France.
Poste en CDI, basé à Cesson-Sévignè (35)
Vos missions :
Comme son nom l'indique, l'équipe est dédié à la thématique cancer. Actuellement des outils d'aide au diagnostic ou au suivi de traitement sont en développement en lien avec le tissu hospitalier. Des outils d'aide à la décision thérapeutique viendront avec cette nouvelle mission. Pour l'ensemble de ces outils, l'un des enjeux principaux réside dans la médecine personalisée, c'est à dire, d'être capable de fournir une prédiction pour un patient précis, et non pour un patient moyen dans une population.
Le poste proposé a pour objectif le développement d’IA explicatives permettant de prédire, de manière personnalisée, l'efficacité d'une combinaison de traitements anti-cancéreux. Plus spécifiquement, il s’agit de manipuler des données multiomiques issus de larges screening (dont CRISPR-Cas9) dans des modèles biologiques in vitro et in vivo.
Vous aurez donc pour mission de :
- Faire un état de l'art sur les modèles cellulaires in vitro
- Inventorier et préparer des jeux de données de grandes dimensions en appliquant les standardisations nécessaires
- Construire des IA explicables et prédictives, comme les réseaux de neurones visibles par exemple.
- Utiliser ces modèles pour proposer de nouvelles cibles biologiques et/ou thérapeutiques.
- Documenter les méthodes et le code informatique produit dans l’objectif de faciliter la mise en œuvre ultérieure d’une application commerciale.
- Communiquer autour de la technologie auprès des audiences les plus scientifiques jusqu'au moins spécialisé
Vos qualifications :
Vous êtes issu.e d'une formation d'Ingénieurs ou Master Universitaire.
Vous souhaitez valoriser une première expérience (stage / apprentissage inclus) en Mathématiques Appliquées / Bio-Informatique.
Vous maitrisez les concepts de réseau de neurones, de modélisation et simulation diverses et êtes à l’aise avec l’analyse de données.
Vous avez une connaissance de la biologie cellulaire et de ses voies de signalisation.
Vous avez une connaissance des différents types de données cellulaires omiques, et avez déjà manipuler l'un de ses types.
Vous avez de bonnes bases en programmation Python et maitrisez les packages essentiel à l'implémentation de réseau de neurones et à l'analyse de nombreuses données. Vous avez également des connaissances en Linux et Git.
Votre niveau d’anglais est courant afin de pouvoir communiquer avec les différentes équipes et lire la documentation scientifique et technique.
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